尽管许多微生物对公众健康的影响并不大，但因其会产生嗅和味而令人反感。不仅影 响饮用水的可接受性，它们的存在表明水处理和／或输配水系统的维护状况不够完善。
１）放线菌和真菌
地表水水源包括水库中存在有大量的放线菌和真菌，它们在输配水系统中的非适宜材 料（如橡胶）上也能生长。放线菌和真菌会产生土臭素，２ 甲基异莰醇和其他物质，使饮用水 产生令人讨厌的味道和气味。
２）蓝藻和其他藻类
水库水和河水中蓝藻和其他藻类的水华可能会妨碍絮凝沉淀和过滤，使滤后水有颜色 并且浑浊。它们也会产生土臭素、２ 甲基异莰醇和其他化学物质，而这些物质在饮用水中的 味阈值一般只有几个纳克每升。某些蓝藻的产物———藻毒素———对健康也有直接影响（见 ８．５．１节），但是蓝藻致嗅味物质的产生似乎与藻毒素的产生并无关联。
３）无脊椎动物活体
无脊椎动物天然存在于许多饮用水供水水源中，常大量滋生于浅滩、开口井等。当颗粒 物屏障不完全有效时，少数无脊椎动物会穿透水处理工艺，从而寄存在过滤或输配水系统 中。其浮游性使得它们及其幼虫能够穿透水厂的滤池和储水库的通风孔。
出于控制的目的，无脊椎动物可分为两个组别。第一组是在水中或水面上自由游动 的生物，诸如甲壳类蚤状钩虾（淡水虾）、片脚类生物、剑水蚤和圆形盘肠蚤。第二组是其 他无脊椎动物，它们或沿水面活动或定居其中，如水虱、腹足类、斑马贻 贝、其他双壳类软体动物和苔藓虫［羽苔虫］，或 者栖居在黏泥中［如仙女虫、线虫和摇蚊幼虫］。在暖和的天气里，慢砂滤池 有时能释放出小昆虫的幼虫［摇蚊属和库蚊］到水体中。在某 些情况下，这些小昆虫能进行单性生殖（也就是无性生殖），这会使储水库与配水管的问题 恶化。
许多无脊椎动物能通过摄取水中或管道及储水罐表面淤泥中的细菌、藻类及原生 动物而生存。很少有输配水系统是完全没有动物生存的。然而，无脊椎动物群体的密 度和组成差别很大，从重度侵染，包括令用户讨厌的随时可见的种类，到鲜有出现的微 小种类。
管道饮用水供应商认为温带地区无脊椎动物的存在在很大程度上会直接或通过它们与 水变色的关联造成饮用水可接受性方面的问题。大型无脊椎动物种群还预示着水中高水平 的有机物，这可引起其他水质问题，如微生物繁殖。相比之下，在热带和亚热带国家，有一些 充当寄生虫二级宿主的水生无脊椎动物种类。例如，小甲壳类动物剑水蚤是麦地 那龙线虫的中间宿主（见７．１．１节和１１．４节）。然而，尚无证据证 明麦地那龙线虫可通过管道供水传播。饮用水中无脊椎动物的存在（尤其是肉眼可见种 类），会引起用户对供水水质的担忧，应加以控制。
当采用快速过滤工艺时，这些动物可穿透水处理装置和主管网，但即使是运行良好的水 处理厂，也可能产生同样问题。通过冲洗和／或定期清洁主管网通常可以控制无脊椎动物的 侵染。 对管网配水系统中无脊椎动物侵染的处理详见支持文件《安全管网水》（附录１）第６章。
４）铁细菌 在含有亚铁和二价锰盐的水中，铁细菌产生的氧化（或暴露于空气）会导致铁锈色沉积 物沉积在蓄水池、管道和沟槽的壁上，并导致携带的沉积物进入水中。