消毒是饮用水处理过程中防范诸多病原体（尤其是细菌）的一个有效屏障，也应该被用 于受到粪便污染的地表水和地下水的处理。剩余消毒剂能够为应对低水平的污染以及抑制 管网系统中微生物的生长提供部分安全保障。
对受到粪便污染的饮用水供应进行化学消毒能降低致病的总体风险，但这并不足以保 证饮水安全。比如说饮用水的氯消毒对于一些原虫病原体，特别是隐孢子虫和某些病毒的 去除效果有限。消毒的效果在有絮状物和颗粒存在时可能也不尽如人意，因为它们能保护 病原体免受消毒剂的作用。高浑浊度会降低消毒作用对微生物的影响，并促进细菌的生长， 从而大大增加氯的需求。实施整体管理策略是必不可少的，在这个策略中，通过实施多级屏 障（包括原水保护、合适的处理工艺以及存储和输配中的保护）并结合消毒措施来预防或者 去除微生物污染。
水处理过程中化学消毒剂的使用常常导 致化学副产物的产生。但是，与消毒不充分 可能引起的风险相比，这些副产物带来的健 康风险是很小的。重要的是，不能为了控制消毒副产物而牺牲消毒效果。
有些消毒剂，比如氯，作为饮用水的消毒剂能够很容易对其进行监测和控制。建议使用 氯消毒时进行频繁的监控。
水处理过程中化学消毒剂的使用常常导 致化学副产物的产生。但是，与消毒不充分 可能引起的风险相比，这些副产物带来的健 康风险是很小的。重要的是，不能为了控制消毒副产物而牺牲消毒效果。
有些消毒剂，比如氯，作为饮用水的消毒剂能够很容易对其进行监测和控制。建议使用 氯消毒时进行频繁的监控。