这些准则完全适用于淡化水供应系统，但是，要强调的是，脱盐也表现出一定的特殊性， 概括如下。
（１）脱盐水具有很低的总有机碳含量和低的消毒剂需求，因此，尽管海水中含有的溴离子在消毒时可能生成有机溴化物，但总体来说消毒副产物可忽略不计。膜处理和蒸馏脱盐工艺对去除大分子量有机物非常有效，实际上，所有无机物和挥发性有机物在加热脱盐过程中被除去。用膜处理时，硼和某些低分子量有机物可能不会被去除，因此，提高膜的处理能力很重要。因为某些工艺（特别是蒸馏和反渗透）在去除微生物和化学组分方面有明显的高效性，这些工艺可作为独立处理单元使用，或者结合低水平的消毒剂余量使用。更多的信息，请参阅支持文件《水处理和病原微生物控制》（附录１）。预处理主要适用于保护脱盐工艺，但同时它也可去除苦咸水或含盐水中的某些有害成分。
（１）脱盐水具有很低的总有机碳含量和低的消毒剂需求，因此，尽管海水中含有的溴离子在消毒时可能生成有机溴化物，但总体来说消毒副产物可忽略不计。膜处理和蒸馏脱盐工艺对去除大分子量有机物非常有效，实际上，所有无机物和挥发性有机物在加热脱盐过程中被除去。用膜处理时，硼和某些低分子量有机物可能不会被去除，因此，提高膜的处理能力很重要。因为某些工艺（特别是蒸馏和反渗透）在去除微生物和化学组分方面有明显的高效性，这些工艺可作为独立处理单元使用，或者结合低水平的消毒剂余量使用。更多的信息，请参阅支持文件《水处理和病原微生物控制》（附录１）。预处理主要适用于保护脱盐工艺，但同时它也可去除苦咸水或含盐水中的某些有害成分。
（２）脱盐处理过的水矿物质含量低，通常对所接触的材料，如用于输配水管、储水容器、 管道等的材料，都有侵蚀性。后期处理过程中，为降低水的侵蚀性，在进入输配水系统前必须将水稳定化或重新加入矿物质。水稳定化通常通过添加化学成分如钙和镁的碳酸盐并调整水的ｐｈ值，或者通过和少量富含矿物质的水进行混合而实现。海水和经电解生成次氯酸盐后的废弃海水已用于上述用途，但后一种使用废弃海水的方法已基本不用，因为水中会
生成溴酸盐。混合用水应进行预处理以保证它们的微生物安全。因为脱盐处理后水中的剩余消毒剂水平可能不足以控制混合用水中的病原微生物。
（３）脱盐水中含有的溶解性固体和必需元素如钙和镁等水中常见元素，要低于通常的浓度（见支持文件《饮用水中的钙和镁》，附录１）。推荐人体每日必需元素摄入量，饮用水通常贡献其中一小部分，大部分是通过食物摄入。氟化物在水脱盐后也会缺失，除非在输配水前进行加氟。糖消费量高的国家可以考虑使用这种加氟的方法（ｗｈｏ，２００５ｂ）。温暖气候地区输配水的高温以及长距离输水中保持消毒剂余量的困难性可能会导致水
中微生物的再生，这取决于水中营养成分的有效性。尽管这种生长可能没有影响健康的意义（见支持文件《异养菌平板计数和饮用水安全》，附录１），但对水的可接受性是有影响的。 输配水系统中使用氯胺消毒是代替自由氯消毒的一种有利选择，因为氯胺消毒维持时间长， 高温下不易分解，尽管使用氯胺消毒且存在多余的氨氮时，需考虑由于生物膜上微生物作用而导致的亚硝酸盐生成。