在特定状况下，需要考虑引入更多的抗性指标，如噬菌体和／或细菌孢子（见７．４节）。
饮用水供应的微生物质量验证需保证污染检出率最高，这样采集的样本才能反映输配 过程中水质的可能变化。这通常意味着要考虑污染可能增加的地点和时间。 粪便污染并不均匀分布在整个管道配水系统中。在水质良好的输配水系统中，采集相 对少的样品时，会显著减少粪便指示菌检出的概率。
当系统中粪便指示菌的检测大多为阴性结果时，可以通过频率更高的有／无（ｐｒｅｓｅｎｃｅ／ ａｂｓｅｎｃｅ，ｐ／ａ）检测以增加检出污染的机会。这种ｐ／ａ检测法比定量方法更简单、更快且 花费更少。将ｐ／ａ方法和定量法对比时，证明ｐ／ａ法对粪便指示菌的检出率更高。然而， 只有当系统中粪便指示菌的大多数检测结果呈阴性时，才适合用ｐ／ａ检测法。 检验粪便指示菌的采样越频繁时，污染物被检测出的可能性越高。用简单方法作更多 次检验比用复杂方法或作系列检验作较少的检测更有价值。 污染的性质和污染的可能性，可因降雨和其他当地条件的变化而有季节性差异。样品 采集在一般情况下应是随机的，但当有流行病、洪水，或突发异常运行或随后的供水中断或 维修工作后，应增加采样次数。
饮用水微生物质量验证的建议最小样本量如表４．４所示。
